MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica F92 chromosome

Total Repeats: 9414

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019537	TTA	2	6	3945	3950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019537	TAG	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019537	AGT	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019537	CAG	2	6	6161	6166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019537	TAGC	2	8	6169	6176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019537	TAC	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019537	TTA	2	6	6217	6222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019537	AT	3	6	6307	6312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019537	TAG	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019537	TA	3	6	6362	6367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019537	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019537	ATTA	2	8	6419	6426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019537	TAA	2	6	6454	6459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019537	TGG	2	6	6467	6472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019537	AAG	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019537	T	6	6	6505	6510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019537	CAC	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019537	AAT	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019537	TTC	2	6	6547	6552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019537	ATGA	2	8	6570	6577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019537	T	6	6	6850	6855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019537	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019537	AAT	2	6	7854	7859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019537	GAT	2	6	7860	7865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019537	TAT	2	6	7880	7885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019537	CAA	2	6	7898	7903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019537	GAA	2	6	7909	7914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019537	ATA	2	6	8469	8474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019537	T	7	7	8483	8489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019537	A	6	6	8492	8497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019537	AGC	2	6	8519	8524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019537	T	8	8	8525	8532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019537	ATTA	2	8	8572	8579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019537	T	6	6	11104	11109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019537	A	7	7	11112	11118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019537	ATTT	2	8	11127	11134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019537	TAG	2	6	11177	11182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019537	ATA	2	6	11189	11194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019537	T	6	6	11683	11688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019537	ATA	2	6	11692	11697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019537	TCT	2	6	11732	11737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019537	ATT	2	6	11740	11745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019537	ATA	2	6	11748	11753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019537	T	6	6	11773	11778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019537	TAA	2	6	15068	15073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019537	TAA	2	6	15088	15093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019537	TGC	2	6	15245	15250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019537	TGA	2	6	15302	15307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019537	ATT	2	6	15467	15472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019537	GCA	2	6	15490	15495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019537	GAT	2	6	15523	15528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019537	GCT	2	6	15539	15544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019537	CTC	2	6	15594	15599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019537	AG	3	6	15617	15622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019537	TGA	2	6	15643	15648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019537	CAA	2	6	15767	15772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019537	GCA	2	6	15773	15778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019537	TTA	2	6	16843	16848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019537	TAT	2	6	17240	17245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019537	ATT	2	6	17268	17273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019537	TAT	3	9	17285	17293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019537	TAA	2	6	19135	19140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019537	ATT	2	6	19164	19169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019537	AGA	2	6	19187	19192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019537	TAA	2	6	19207	19212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019537	CAAA	2	8	19218	19225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019537	AGCTA	2	10	19244	19253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019537	TGA	2	6	19260	19265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019537	TAAA	2	8	20473	20480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019537	TTAAT	2	10	20485	20494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019537	TAAC	2	8	20495	20502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019537	CAT	2	6	20548	20553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019537	CT	3	6	20561	20566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019537	ACCA	2	8	20633	20640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019537	TGATT	2	10	20672	20681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019537	TAT	2	6	20723	20728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019537	AAT	2	6	20775	20780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019537	TTC	2	6	20793	20798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019537	TAG	2	6	20837	20842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019537	ACC	2	6	20880	20885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019537	ATA	2	6	20888	20893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019537	CAT	2	6	20915	20920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019537	CTG	2	6	20945	20950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019537	TTAA	2	8	20956	20963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019537	TAA	2	6	21096	21101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019537	TA	3	6	21986	21991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019537	T	6	6	21994	21999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019537	AT	3	6	22010	22015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019537	A	6	6	22016	22021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019537	A	7	7	22029	22035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019537	TAA	2	6	22086	22091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019537	ATT	2	6	22168	22173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019537	AGTT	2	8	22193	22200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019537	TAA	2	6	22211	22216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019537	T	6	6	22234	22239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019537	ATT	2	6	22240	22245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019537	TTTA	2	8	22252	22259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019537	T	6	6	22269	22274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019537	GTA	2	6	22307	22312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019537	T	6	6	22372	22377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019537	ATA	2	6	22388	22393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019537	TTA	2	6	22405	22410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019537	ATA	2	6	22416	22421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019537	ATT	3	9	22433	22441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019537	T	6	6	22447	22452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019537	GGC	2	6	22459	22464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019537	AAGA	2	8	22660	22667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019537	TTA	2	6	22692	22697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019537	TTA	2	6	22797	22802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019537	TTA	2	6	22897	22902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019537	TAAA	2	8	24165	24172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019537	A	7	7	24170	24176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019537	TA	3	6	24182	24187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019537	TAAT	2	8	24227	24234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019537	TTAA	2	8	24289	24296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019537	T	6	6	24319	24324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019537	A	7	7	24380	24386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019537	AAGGTT	2	12	24392	24403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019537	TGA	2	6	24420	24425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019537	AT	3	6	24475	24480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019537	GTT	2	6	24742	24747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019537	TAG	2	6	24757	24762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019537	TTTA	2	8	24791	24798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019537	TA	3	6	24804	24809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019537	TA	3	6	24852	24857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019537	T	6	6	24878	24883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019537	ATTA	2	8	24899	24906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019537	AT	3	6	24959	24964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019537	T	7	7	25005	25011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019537	TCAG	2	8	25026	25033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019537	CTA	2	6	25058	25063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019537	A	6	6	25105	25110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019537	AG	3	6	25155	25160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019537	TAT	2	6	25223	25228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019537	TGT	2	6	25250	25255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019537	ATA	2	6	25297	25302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019537	CAAAG	2	10	25307	25316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019537	AGT	2	6	25343	25348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019537	ATA	2	6	25389	25394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019537	TGT	2	6	25398	25403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019537	TA	3	6	25405	25410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019537	TGC	2	6	25418	25423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019537	TAA	2	6	25526	25531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019537	AAT	2	6	25545	25550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019537	CTG	2	6	25585	25590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019537	A	6	6	25600	25605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019537	AGA	3	9	25631	25639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019537	TAA	2	6	25676	25681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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